ไอพิแดครีนเป็นตัวยับยั้งโคลีนเอสเทอเรสแบบย้อนกลับได้ ใช้หลักในการรักษาโรคไมอัสเทเนียกราเวิส ซึ่งเป็นโรคภูมิต้านทานตนเองที่ทำให้กล้ามเนื้ออ่อนแรงและเหนื่อยล้า โดยยับยั้งการสลายอะเซทิลโคลีน ช่วยเพิ่มการส่งสัญญาณโคลิเนอร์จิกที่จุดเชื่อมกล้ามเนื้อประสาท ทำให้กล้ามเนื้อแข็งแรงขึ้นและลดอาการ เช่น ตาเหล่ ปากเบี้ยว และอ่อนแรงทั่วไป

นอกจากนี้ ไอพิแดครีนยังใช้เป็นสารเสริมสมองและสารป้องกันเซลล์ประสาท ช่วยปรับปรุงความจำ ความสนใจ และความชัดเจนทางจิตในผู้ป่วยที่มีความบกพร่องทางความรู้ความเข้าใจ เช่น จากโรคอัลไซเมอร์ โรคสมองเสื่อม หรือภาวะเสื่อมของระบบประสาทอื่นๆ โดยสนับสนุนการสื่อสารระหว่างเซลล์ประสาทและการทำงานทางความรู้ความเข้าใจโดยรวม

ไอพิแดครีนยังใช้ในการฟื้นฟูหลังเส้นเลือดในสมองแตก เพื่อช่วยคืนการทำงานทางระบบประสาทและลดความรุนแรงของผลกระทบหลังโรค สมบัติป้องกันเซลล์ประสาทช่วยส่งเสริมการสร้างเซลล์ประสาทใหม่และปกป้องเซลล์ประสาทจากความเสียหาย ทำให้มีคุณค่าในการจัดการโรคระบบประสาทส่วนกลางต่างๆ ในบางกรณี อาจช่วยบรรเทาอาการซึมเศร้าและวิตกกังวลโดยมีผลบวกต่ออารมณ์และสุขภาพจิต