2-(3,5-difluorophenyl)acetaldehyde เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมและสารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการผลิตยาที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลเป้าหมายที่มีโครงสร้างเฉพาะ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านไวรัส นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ๆ เพื่อศึกษาประสิทธิภาพและกลไกการออกฤทธิ์ของสารประกอบทางยา