2-(2-ฟลูออโร-5-เมทอกซีฟีนิล)อะซิติกแอซิดถูกใช้หลักในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการผลิตยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสัน เนื่องจากโครงสร้างที่เข้ากันได้กับโมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในงานวิจัยสำหรับการพัฒนาสารประกอบใหม่ที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบและยาบรรเทาปวด โครงสร้างอะโรมาติกฟลูออรีนของมันทำให้มีคุณค่าต่อเคมีทางยาในการเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพของยาที่เป็นผู้สมัคร