1-(tert-Butyl)piperazine dihydrochloride ถูกนำไปใช้ในหลายด้านของการวิจัยและพัฒนาทางเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่มีฤทธิ์ทางยา มันมักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกลุ่มของสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยารักษาอาการซึมเศร้าหรือยาต้านโรคจิต นอกจากนี้ยังอาจถูกใช้ในการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับตัวรับในร่างกาย (receptors) และกลไกการทำงานของยา เพื่อพัฒนายาใหม่ที่มีประสิทธิภาพและความปลอดภัยสูงขึ้น