1-(3-ฟลูออโร-4-เมทิลฟีนิล)อีทาไมน์ ไฮโดรคลอไรด์ เป็นสารประกอบที่ใช้หลักในสาขาเคมีทางการแพทย์ (medicinal chemistry) ในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ตัวยาภarmaceutics ต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีหมู่ฟลูออรีนและเมทิลแทนที่บนวงแหวนฟีนิล ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง มักนำไปใช้ในการพัฒนายาเฉพาะระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าหมายไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น ภาวะซึมเศร้า วิตกกังวล หรือโรคพาร์กินสัน การมีอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความสามารถของสารในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ ส่งผลให้ปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของยาที่ได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาการจับกับตัวรับและปรับแต่งยาให้มีประสิทธิภาพและความเลือกสรรที่ดีขึ้น