ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยเภสัชกรรม สารประกอบนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างที่มีทั้งส่วน morpholine และ piperazine ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะสำหรับภาวะเช่น ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และโรคสเคิโซฟรีเนีย นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบที่มีคุณสมบัติต้านมะเร็ง โดยโครงสร้างทางเคมีสามารถปรับแต่งเพื่อเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายเซลล์เฉพาะ ในเคมีเภสัชกรรม มักนำมาใช้เพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ของยาตัวสมัคร เช่น ความละลายและชีวประสิทธิภาพ นอกเหนือจากเภสัชกรรม ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกสร้างสำหรับสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีหน้าที่หลากหลาย