1,2,2-Trimethylpiperazine dihydrochloride ถูกใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารชีวภาพต่าง ๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ยาต้านอาการหลอนประสาทและยาต้านซึมเศร้า นอกจากนี้ ยังนำมาใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการศึกษารับเซอร์ ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจเส้นทางชีวเคมี ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อผลิตสารเคมีที่ซับซ้อน