(S)-3-(2-Fluorophenyl)morpholine เป็นสารประกอบที่ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมียารักษาโรคในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ ลักษณะโครงสร้างของมัน รวมถึงวงแหวนมอร์โฟลีนและกลุ่มฟลูออโรฟีนิล ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา มันมักถูกนำมาใช้ในการออกแบบและผลิตยาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยาลดความวิตกกังวล เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับระบบสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสร้างโมเลกุลที่มีการประยุกต์ใช้ที่เป็นไปได้ในการรักษาอาการปวดและการอักเสบ บทบาทของมันในการค้นพบยาเน้นย้ำถึงความสำคัญในการปรับปรุงคุณสมบัติทางเภสัชวิทยาและเพิ่มประสิทธิภาพของยา