สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบเบสไพเพอร์ราซีนต่างๆ ซึ่งมักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการออกแบบและสร้างยาตัวสมุครที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท เช่น ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และโรคจิตเภท เนื่องจากส่วนไพเพอร์ราซีนสามารถโต้ตอบกับตัวรับสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการเตรียมโมเลกุลคีเรล ซึ่งสเตอรีโอเคมีของมันมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์แบบเอนานติโอเซเลคทีฟ การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปสู่เคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการปรับปรุงคุณสมบัติคล้ายยา รวมถึงการดูดซึมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม