(S)-1-(6-Methoxypyridin-3-yl)ethanamine hydrochloride เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา (APIs) สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการผลิตยาที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสันและโรคซึมเศร้า เนื่องจากคุณสมบัติโครงสร้างที่โต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างโมเลกุลคีรัล ซึ่งมีความสำคัญสำหรับการพัฒนายาที่บริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียง การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งใช้ในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการศึกษาทางเภสัชวิทยาต่อไป