(R)-3-Benzylmorpholine ถูกนำมาใช้เป็นหลักในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะ chiral building block ในการสังเคราะห์ active pharmaceutical ingredients (APIs) ต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่มี stereochemistry เฉพาะเจาะจง ซึ่งมีความสำคัญสำหรับยาที่ต้องการ enantiomeric purity สูงเพื่อให้มั่นใจในประสิทธิภาพและความปลอดภัย มันมักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายา central nervous system (CNS) รวมถึงยาที่ใช้รักษา neurological disorders เนื่องจาก morpholine core ซึ่งสามารถเพิ่ม bioavailability และ binding affinity ต่อ biological targets นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็น intermediate ในการผลิต ligands สำหรับ asymmetric catalysis ช่วยในการสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยและพัฒนา โดยใช้ในการสำรวจ new therapeutic agents และ optimize drug delivery systems