(2-Methoxybenzyl)hydrazine hydrochloride เป็นสารตั้งต้นสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการเตรียมสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาต่างๆ มักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ไฮดราซโซน ซึ่งมีคุณค่าในการพัฒนายารักษาโรคระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยากล่อมประสาทและยาต้านชัก นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังใช้ในการสร้างเบส Schiff ซึ่งมี 응ใช้ในเคมีเชิงประสานและเป็นสารต้านจุลชีพหรือต้านมะเร็งที่เป็นไปได้ บทบาทของมันในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอโรไซคลิกยังขยายประโยชน์ในเคมียารักษา โดยเฉพาะในการออกแบบโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา