(2-Chloro-3-iodophenyl)methanamine ใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพต่าง ๆ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งหมู่คลอโรและไอโอโด ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างเอนทิตีเคมีที่ซับซ้อน สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับปฏิกิริยาที่เร่งด้วยโลหะ รวมถึงในการออกแบบยาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาทหรือภาวะทางการแพทย์อื่น ๆ แหวนอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยฮาโลเจนยังทำให้มีประโยชน์ในการศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรมในเคมียารักษา