(2-Chloro-4,5-difluorophenyl)methanamine ใช้หลักในฐานะสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี โครงสร้างที่มีทั้งหมู่คลอโรและฟลูออโรทำให้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานที่มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง

ในเภสัชกรรม มักใช้ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สำหรับยาที่กำหนดเป้าหมายโรคระบบประสาทส่วนกลาง โรคหัวใจและหลอดเลือด หรือโรคติดเชื้อ หมู่ฟลูอออโรช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพของสารประกอบที่ได้

ในเกษตรเคมี สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืช สารกำจัดเชื้อรา หรือสารกำจัดแมลง หมู่ difluorophenyl สามารถช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรของสารเกษตรเคมีเหล่านี้ ส่งผลให้การควบคุมศัตรูพืชหรือวัชพืชมีประสิทธิผลยิ่งขึ้น

นอกจากนี้ ยังอาจนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อออกแบบวัสดุใหม่หรือลิแกนด์ในเคมีเชิงประสาน โดยคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ที่เป็นเอกลักษณ์สามารถมีอิทธิพลต่อพฤติกรรมของคอมเพล็กซ์โลหะ