(1-Methylcyclobutyl)methanamine hydrochloride ใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพต่าง ๆ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลขนาดเล็กที่มีศักยภาพในการบำบัดรักษา โครงสร้างของมันซึ่งมีวงแหวนไซโคลบิวทิล ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบยาที่เล็งเป้าไปยังตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะเจาะจง มักในบริบทของโรคระบบประสาทส่วนกลางหรือโรคเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยา หรือเป็นบล็อกก่อสร้างในเคมียารักษาเพื่อสำรวจความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลาย ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในสภาวะปฏิกิริยาแบบน้ำ