ใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์และเคมีทางการแพทย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิเพอร์ราซีน ซึ่งมักพบในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหลายชนิด เช่น ยาต้านจิตประดิษฐ์ ยาต้านเชื้อแบคทีเรีย หรือสารยับยั้งเอนไซม์เฉพาะ การมีหมู่ tert-butyl carbamate (Boc) ช่วยป้องกันไนโตรเจนในพิเพอร์ราซีนระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้ควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้ดี ส่วนหมู่ 4-chlorophenoxy อาจช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายหรือการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพ นิยมใช้ในขั้นตอนการพัฒนายาใหม่ในห้องปฏิบัติการ