ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาแก้ระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านโรคลมชัก โครงสร้างไซโคลโพรเพนที่ยึดติดกับหมู่แทนที่ thiophen-2-yl ช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความเลือกในการจับกับโมเลกุลชีวภาพ ใช้บ่อยในเคมีทางการแพทย์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างโครงสร้างและกิจกรรม (SAR) เนื่องจากโครงสร้างที่แข็งและความสามารถในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์สำหรับโปรแกรมค้นพบยาที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท