ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ต่อความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง แกนพิเพอราซีนที่มีสเตอริโอเคมีที่กำหนดไว้ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างยาตัวสมัครที่มีความเลือกสรรสูงและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ปรับปรุงแล้ว ใช้กันทั่วไปในเคมียารักษาโรคสำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-ฤทธิ์ โดยเฉพาะในการปรับปรุงตัวปรับตัวรับโดพามีนหรือเซโรโทนิน นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์สำหรับการคัดกรองทางชีวภาพในขั้นตอนเริ่มต้นของการค้นพบยา โครงสร้างที่มีความเฉพาะตัวของสเตอริโอเซนเตอร์ช่วยให้สามารถควบคุมฤทธิ์ทางชีวภาพได้อย่างแม่นยำ ส่งผลให้มีประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงในผลิตภัณฑ์สุดท้าย