ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนผสมออกฤทธิ์สำหรับยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิตเภท มีบทบาทสำคัญในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน เนื่องจากมีทั้งกลุ่มฟังก์ชันเอมีนและเอเทอร์ ซึ่งช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีได้หลากหลาย นิยมใช้ในการเตรียมสารประกอบอะโรมาติกที่ถูกแทนที่ด้วยไตรฟลูออโรมิทิล ซึ่งมีคุณค่าในเคมียารักษาโรคเนื่องจากความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการเพิ่ม bioavailability นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลงใหม่ๆ โดยกลุ่มไตรฟลูออโรมิทิลช่วยเพิ่มความคงตัวในสิ่งแวดล้อมและความจำเพาะต่อเป้าหมาย โดยเฉพาะในกลุ่มฟีนิลยูเรียสำหรับควบคุมวัชพืช