ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) และยาต้านซึมเศร้า โครงสร้างของมันช่วยในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน เนื่องจากมีทั้งกลุ่มที่ให้อิเล็กตรอนและดึงอิเล็กตรอน ซึ่งเพิ่มปฏิกิริยาในปฏิกิริยาการจับคู่ นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสีย้อมและวัสดุฟังก์ชันที่ต้องการความต้านทานความร้อนและเคมีสูง