ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ต้องการโครงสร้างไซโคลบิวเทนที่มีความเฉพาะตัว โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ซึ่งโครงสร้างไซโคลบิวเทนที่มีหมู่แอมีนและหมู่เมทอกซีเมทิลสามารถทำหน้าที่เป็นโครงสร้างหลัก (scaffold) ในการพัฒนายาที่มีฤทธิ์เฉพาะเจาะจงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์หรือตัวรับในเซลล์ สารนี้มีประโยชน์ในการสร้างสารตั้งต้นสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือลดผลข้างเคียงของยา นอกจากนี้ยังใช้ในงานเคมีอินทรีย์ขั้นสูงเพื่อศึกษาผลกระทบของรูปเรขาคณิต (cis-configuration) ต่อการตอบสนองทางชีวภาพและการละลายในตัวทำละลายต่าง ๆ