ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านซึมเศร้า โครงสร้างอะโรมาติกฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในยาที่เป็นผู้สมัครบำบัด มักใช้ในเคมีทางการแพทย์สำหรับการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ได้ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัล โดยที่เอสเตอร์ฟลูออรีนช่วยปรับปรุง lipophilicity และการซึมผ่านเมมเบรน