ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) โครงสร้างไซโคลเฮกซานที่แข็งและหมู่ฟังก์ชันทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีสเตอรีโอเคมีกำหนดไว้ หมู่อัลไคน์เอทิลไนล์ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) ได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น ปฏิกิริยา Huisgen cycloaddition ระหว่างอัลไคน์กับอะไซด์ ซึ่งช่วยในการต่อเติมโครงสร้างโมเลกุลอย่างจำเพาะ นิยมใช้ในเคมีเภสัชกรรมเพื่อสร้างอนุพันธ์ของเอมีนชีวภาพ รวมถึงการรักษาโรคทางระบบประสาท และใช้ในการเตรียมลิแกนด์รับเซอร์ใหม่เนื่องจากสามารถเลียนแบบโครงสร้างของสารสื่อประสาท