4-(อินโดลิน-5-อิล)มอฟโฟลีนไฮโดรคลอไรด์ ใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลทางชีวภาพที่ active ต่าง ๆ โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา therapeutic ที่มีศักยภาพ โดยมุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง นักวิจัยใช้ส่วนประกอบมอฟโฟลีนและอินโดลีนเพื่อออกแบบสารประกอบที่มีความสัมพันธ์การจับกับตัวรับเฉพาะที่เพิ่มขึ้น นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสำรวจยาใหม่สำหรับรักษาโรคต่าง ๆ เช่น ภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท รูปแบบไฮโดรคลอไรด์ช่วยให้ละลายน้ำได้ดีขึ้นและมีความเสถียรภาพสูง ทำให้เหมาะสำหรับการศึกษาแบบทดลองและการศึกษาก่อนคลินิก