5-Chloro-8-iodo-1,6-naphthyridine เป็นสารเคมีที่ใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในด้านการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือ intermediate ในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งอาจมีศักยภาพในการรักษาโรคต่าง ๆ เช่น โรคติดเชื้อหรือโรคมะเร็ง นอกจากนี้ ยังอาจถูกใช้ในการศึกษากลไกการออกฤทธิ์ของยาและปฏิสัมพันธ์กับเป้าหมายทางชีวภาพในระดับโมเลกุล เนื่องจากโครงสร้างของมันมีความเหมาะสมสำหรับการปรับเปลี่ยนทางเคมีเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะเจาะจงของยา