2-Chloro-1,7-naphthyridine ใช้ในงานวิจัยเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีคุณสมบัติทางรักษา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่กำหนดเป้าหมายต่อโรคทางระบบประสาทและการติดเชื้อ สารนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์อินทรีย์ ช่วยให้สามารถสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ ยังนำมาใช้ในการศึกษเคมีเฮเทโรไซคลิกเพื่อสำรวจปฏิกิริยาเคมีและเส้นทางใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่วิทยาศาสตร์วัสดุ โดยมีส่วนในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์หรือทางแสงที่ไม่เหมือนใคร