ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับยาและสารเคมีละเอียด หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Heck ซึ่งช่วยในการสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน นิยมใช้ในการพัฒนาสีย้อม โพรบเรืองแสง และโพลิเมอร์พิเศษ เนื่องจากคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ของโครงสร้างนาฟทาลีน นอกจากนี้ยังถูกศึกษาว่าเป็นบล็อกก่อสร้างในเคมียารักษาโรคสำหรับการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์หรือลิแกนด์ตัวรับ ซึ่งอะตอมฮาโลเจนช่วยเพิ่มการจับคู่หรือความเสถียรทางเมแทบอลิซึม โดยเฉพาะในการผลิตสารเรืองแสงและสารตั้งต้นสำหรับยารักษาโรค นิยมนำมาใช้เป็นตัวทำปฏิกิริยาในงานวิจัยด้านโฟโตเคมี ทำให้เหมาะสำหรับพัฒนาเป็นเซนเซอร์ตรวจจับสารเคมีหรือประยุกต์ใช้ในวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ และใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารประกอบไอโอดีนที่มีความสำคัญในงานถ่ายภาพทางการแพทย์