Morpholin-2-ylmethanol ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการเตรียมสารประกอบเภสัชกรรมต่าง ๆ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังภาวะทางระบบประสาทและหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช หมู่ฟังก์ชันของสารประกอบนี้ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในการผลิตโพลิเมอร์และสารเคลือบผิว โดยช่วยเพิ่มคุณสมบัติเช่น การยึดเกาะและความทนทาน ในงานวิจัย มันทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและการพัฒนาวัสดุใหม่