1-Morpholino-1-cyclododecene เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลาย มักใช้ในการเตรียมสารอินทรีย์ที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการพัฒนายา โครงสร้างของมันช่วยในการนำกลุ่ม morpholine และ cyclododecene เข้าสู่โมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งสามารถเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางกายภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งมีส่วนในการสร้างโพลิเมอร์และสารเคลือบพิเศษที่มีลักษณะเฉพาะตัว เนื่องจากโครงสร้างของมันมีความเสถียรและสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่าย