สารนี้ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โครงสร้างของมันประกอบด้วยวงแหวนมอร์โฟลีนแบบ chiral (S) ที่มีสารย่อย 6,6-ไดเมทิล กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ที่ป้องกันไนโตรเจน และกรดคาร์บอกซิลิกที่ตำแหน่ง 2 ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) กลุ่ม Boc ช่วยป้องกันกลุ่มเอมีนในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรและป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ ในขณะที่กรดคาร์บอกซิลิกช่วยให้สามารถดัดแปลงเพิ่มเติม เช่น การจับคู่เปปไทด์หรือเอสเทอร์ ส่วนโมเลกุลมอร์โฟลีนเป็นโครงสร้างที่พบบ่อยในยาหลายชนิด ซึ่งมีส่วนช่วยในกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาโมเลกุลใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษา เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ บทบาทในการอำนวยความสะดวกในการสังเคราะห์สารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเน้นย้ำถึงความสำคัญของมันในเคมีเภสัชกรรม