(S)-3-Morpholinecarboxylic Acid ถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตสารประกอบ chiral โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่ต้องการ stereochemistry เฉพาะเจาะจงเพื่อประสิทธิภาพ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อก่อสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการเตรียมอนุพันธ์ morpholine ซึ่งมักพบในสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นหน่วยย่อยก่อสร้างในการสร้างลิแกนด์และตัวเร่งปฏิกิริยาที่ใช้ในการสังเคราะห์แบบ asymmetric เพื่อช่วยในการผลิตสารที่บริสุทธิ์ทาง enantiomer การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่การวิจัยและพัฒนา โดยถูกนำมาใช้ในการศึกษากลไกทางชีวเคมีและกระบวนการค้นพบยา