(R)-2-Benzylmorpholine ถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะบล็อกก่อสร้างคีรอลสำหรับการสังเคราะห์ส่วนผสมยาสำคัญที่ใช้งานได้หลากหลาย (APIs) คุณสมบัติ stereochemistry ของมันทำให้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่บริสุทธิ์แบบเอนานติโอเมอร์ ซึ่งช่วยให้มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและผลข้างเคียงลดลง สารนี้มักถูกนำมาใช้ในการผลิตยาระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) ซึ่งการควบคุม stereochemical ที่แม่นยำมีความสำคัญต่อกิจกรรมทางรักษา นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาแก้ปวดและยาต้านการอักเสบ ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างการรักษาที่มีเป้าหมายและมีประสิทธิภาพมากขึ้น ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่สาขาเคมีอินทรีย์ ซึ่งถูกใช้ในการสังเคราะห์แบบอสมมาตรและการเร่งปฏิกิริยาเพื่อผลิตโมเลกุลซับซ้อนที่มีความบริสุทธิ์เอนานติโอเมอร์สูง