4-(4-Bromo-2-fluorobenzyl)morpholine ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีวงแหวน morpholine และกลุ่ม benzyl ที่มีฮาโลเจน ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา มันมักถูกนำมาใช้ในการสร้างลิแกนด์สำหรับการศึกษาการจับกับตัวรับ โดยเฉพาะในงานวิจัยทางระบบประสาทและมะเร็ง นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำมาใช้ในการพัฒนาผู้สมัครยาที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือโปรตีนเฉพาะ สนับสนุนความก้าวหน้าในเคมียารักษา