(3-Chlorophenyl)(morpholino)methanone ใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาฟาร์มาซูติคอลต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่ม chlorophenyl และวงแหวน morpholine ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีศักยภาพทางชีวภาพ มักนำไปใช้ในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น ยารักษาโรคจิตหรือยาต้านซึมเศร้า เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสร้างยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืช ซึ่งคุณสมบัติทางเคมีของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นักวิจัยยังสำรวจการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการออกแบบโพลิเมอร์หรือสารเคลือบที่มีคุณสมบัติพิเศษ บทบาทในด้านเหล่านี้เน้นย้ำถึงความสำคัญของมันในการพัฒนาเคมีทางการแพทย์และเคมีอุตสาหกรรม