2-(Morpholinomethyl)benzonitrile ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายาต่างๆ ในเภสัชกรรม โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งวงแหวนมอร์โฟลีนและกลุ่มเบนโซไนไตรล์ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพ โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและโรคหัวใจและหลอดเลือด มักใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งคินาส ซึ่งมีความสำคัญในบำบัดมะเร็ง รวมถึงการพัฒนายาที่มีศักยภาพในการต้านการอักเสบและต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ความตอบสนองของมันยังช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้ผู้วิจัยสามารถปรับคุณสมบัติให้เหมาะสมสำหรับการใช้งานเฉพาะในกระบวนการค้นพบยาและเคมีเภสัชวิทยา