2-Methylmorpholine hydrochloride ใช้หลัก ๆ เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาหรือสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ สารเคมีนี้มีบทบาทสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) คุณสมบัติของมันทำให้เหมาะสำหรับช่วยเหลือในปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ รวมถึงกระบวนการอัลคิลเลชันและอะซิลเลชัน นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร ช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ในงานอุตสาหกรรม ทำหน้าที่เป็นสารทำให้เสถียรหรือสารเติมแต่งในสูตรเคมีบางชนิด เพิ่มประสิทธิภาพหรืออายุการเก็บรักษา ความหลากหลายของมันยังขยายไปถึงการวิจัยและพัฒนา ที่ซึ่งใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกระบวนการใหม่ ๆ