ใช้ในการวิจัยทางภูมิคุ้มกันวิทยาเพื่อตรวจจับและวัดปริมาณการแสดงออกของ CD69 บนเซลล์ภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงการกระตุ้นเริ่มต้นของเซลล์ T, เซลล์ B และเซลล์นักฆ่าโดยธรรมชาติ (NK cells) นิยมนำไปใช้ในเทคนิค flow cytometry และ immunohistochemistry เพื่อศึกษาการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันในโรคต่าง ๆ เช่น โรคภูมิต้านตนเอง การปลูกถ่ายอวัยวะ และมะเร็ง ทำหน้าที่เป็นมาตรฐานอ้างอิงในการพัฒนา assay วินิจฉัยและแอนติบอดีบำบัดที่ขัดต่อเส้นทาง CD69 นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยฟังก์ชันเพื่อยับยั้งการส่งสัญญาณที่ไกล่เกลื่อนโดย CD69 ช่วยให้เข้าใจบทบาทของมันในการอักเสบและการควบคุมลิมโฟไซต์