เพอร์ทูซูแมบใช้ในการรักษามะเร็งเต้านมชนิด HER2-positive ซึ่งเป็นมะเร็งที่มีการแสดงออกของโปรตีน HER2 มากเกินไป โดยมักใช้ร่วมกับทราสทูซูแมบ (Trastuzumab) และเคมีบำบัด เพื่อยับยั้งการเติบโตของเซลล์มะเร็งและป้องกันไม่ให้เซลล์มะเร็งแพร่กระจาย ยานี้ช่วยปรับปรุงอัตราการรอดชีวิตและชะลอการลุกลามของโรคในผู้ป่วย มักใช้ในกรณีที่มะเร็งอยู่ในระยะลุกลามหรือมีการแพร่กระจายไปยังส่วนอื่นของร่างกาย นอกจากนี้ยังอาจใช้ในรูปแบบการรักษาร่วมก่อนการผ่าตัดเพื่อลดขนาดก้อนมะเร็ง ทำให้การผ่าตัดมีประสิทธิภาพมากขึ้น