Nepsilon-Acetyl-L-lysine Hydrochloride ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในวงการวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในการศึกษากระบวนการหลังการแปลรหัสโปรตีน (post-translational modification) ซึ่งเกี่ยวข้องกับการอะซิติเลชันของไลซีน (lysine acetylation) ที่มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการทำงานของโปรตีนและยีน นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารอ้างอิงในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการปรับเปลี่ยนโปรตีน และมีการประยุกต์ใช้ในการศึกษาด้านชีวเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อทำความเข้าใจกลไกการทำงานของเซลล์และโรคต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับการผิดปกติของกระบวนการอะซิติเลชัน