5-Benzyloxy-DL-tryptophan ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีและการพัฒนายา มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับอนุพันธ์ของทริปโตเฟน การประยุกต์ใช้รวมถึงการศึกษากลไกของเอนไซม์และเส้นทางเมแทบอลิซึม ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจบทบาทของทริปโตเฟนในระบบชีววิทยา นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายา therapeutic ที่มีศักยภาพ โดยเฉพาะในสาขาประสาทวิทยาและจิตเวชศาสตร์ ซึ่งอนุพันธ์ของทริปโตเฟนมีบทบาทสำคัญในการปรับกิจกรรมของสารสื่อประสาท สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการเตรียมเปปไทด์และเปปโตไหมเมติกส์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการค้นพบยาและการออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้