ไมโซไธอาโซลถูกใช้หลักๆ เป็นสารยับยั้งที่แรงของห่วงโซ่การหายใจในไมโตคอนเดรีย โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการยับยั้งคอมเพล็กซ์ III (cytochrome bc1 complex) มันถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษาการหายใจของเซลล์และกระบวนการถ่ายทอดอิเล็กตรอน โดยการยับยั้งการถ่ายทอดอิเล็กตรอน มันช่วยให้นักวิจัยเข้าใจกลไกของการฟอสโฟรีเลชันออกซิเดทีฟและการผลิตพลังงานในเซลล์ นอกจากนี้ ไมโซไธอาโซลยังถูกใช้ในการทดลองเพื่อศึกษาบทบาทของ reactive oxygen species (ROS) ในการส่งสัญญาณของเซลล์และการตอบสนองต่อความเครียด ความสามารถในการยับยั้งคอมเพล็กซ์ III อย่างเลือกสรรทำให้มันเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการสำรวจความผิดปกติของไมโตคอนเดรียและผลกระทบต่อโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคเสื่อมถอยของระบบประสาท และการเสื่อมสภาพตามวัย