ใช้เป็นสารยับยั้งที่แรงต่อเอนไซม์ฮีมออกซิเจเนส ซึ่งมีบทบาทในการย่อยสลายฮีม การยับยั้งนี้ทำให้ระดับฮีมภายในเซลล์เพิ่มขึ้น ซึ่งสามารถยับยั้งกิจกรรมของ 5-aminolevulinic acid synthase เอนไซม์ที่จำกัดอัตราในการสังเคราะห์ฮีม เนื่องจากผลกระทบด้านการควบคุมนี้ จึงถูกศึกษาในบริบทของการควบคุมเมแทบอลิซึมของฮีมในโรคเช่น porphyrias

ถูกตรวจสอบสำหรับบทบาททาง درمانیที่เป็นไปได้ในการลดการผลิตบิลิรูบิน ทำให้เกี่ยวข้องกับภาวะเช่น ดีซ่านในทารกแรกเกิด และ Crigler-Najjar syndrome ความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมของฮีมออกซิเจเนสยังให้คุณสมบัติต้านการอักเสบและป้องกันเซลล์ ซึ่งถูกสำรวจในโมเดลของ ischemia-reperfusion injury การปลูกถ่ายอวัยวะ และความผิดปกติของหลอดเลือด

นอกจากนี้ Mn(II)protoporphyrin IX ยังถูกใช้ในการวิจัยเพื่อเลียนแบบผลกระทบของภาวะขาดออกซิเจนและศึกษาการตอบสนองของเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางที่ขึ้นกับฮีม ศูนย์โลหะของมันอนุญาตให้เกิดกิจกรรม redox ที่มีประโยชน์ใน bioassay และการศึกษเอนไซม์บางชนิด

ใช้ Mn(II)protoporphyrin IX เป็นสารยับยั้งการทำงานของเอนไซม์ฮีมออกซิเจเนส-1 (HO-1) ซึ่งมีบทบาทในการลดการอักเสบและป้องกันความเสียห่ายของเซลล์ในหลายระบบของร่างกาย โดยเฉพาะในภาวะที่มีความเครียดจากออกซิเดชัน เช่น โรคตับ โรคเบาหวาน และภาวะขาดออกซิเจนและฟื้นคืนออกซิเจน (ischemia-reperfusion injury) นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการศึกษาวิจัยเพื่อเข้าใจกลไกของระบบต้านอนุมูลอิสระ และการควบคุมการแสดงออกของโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบในโมเดลสัตว์ทดลอง ด้วยคุณสมบัติในการเข้าไปแทรกแซงเส้นทางการส่งสัญญาณของฮีม ทำให้มีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพสำหรับการรักษาโรคเรื้อรังที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบเรื้อรัง