กรด 2-(ไซโคลโพรพิลเมทิล)มาลอนิกเป็นสารเคมีเฉพาะทางแบบสารกลางที่นำมาใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับโมเลกุลซับซ้อนในยา สารเคมีเกษตร และเคมีภัณฑ์ละเอียด โครงสร้างที่มีกลุ่มไซโคลโพรพิลเมทิลติดกับส่วนกรดมาลอนิก ช่วยให้สามารถนำความสามารถนี้เข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย โดยวงแหวนไซโคลโพรเพนมักช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ ความเสถียรทางเมแทบอลิซึม หรือคุณสมบัติอื่นๆ ใช้เป็นประจำในการสังเคราะห์แบบเอสเตอร์มาลอนิก โดยผ่านการอัลไคิลเลชัน ไฮโดรไลซิส และเดคาร์บอกซิเลชัน เพื่อให้ได้อนุพันธ์กรด 3-ไซโคลโพรพิลโพรพาโนอิกและสารกลางที่พัฒนาต่อสำหรับส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) กรดคาร์บอกซิลิกสองตัวช่วยให้สามารถฟังก์ชันนาไลเซชันและปฏิกิริยาคัปปลิ้งเพิ่มเติมได้ตามการประยุกต์ใช้เฉพาะ