ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์กรดอะมิโนและเปปไทด์ โดยเฉพาะในการเตรียมอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน หมู่เอมีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถยืดโซ่เปปไทด์แบบ stepwise ได้อย่างควบคุม ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (solid-phase peptide synthesis) หมู่เอสเตอร์สามารถถูกไฮโดรไลซ์หรือรีดิวซ์แบบเลือกสรรได้ ซึ่งช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมได้ ใช้กันทั่วไปในเคมีเภสัชกรรมสำหรับการสร้างโมเลกุลที่มีไนโตรเจนซับซ้อน รวมถึงยาและสารชีวภาพที่มีกิจกรรม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมกรดอะมิโนที่ไม่เป็นธรรมชาติและ peptidomimetics เนื่องจากมีปฏิกิริยาที่หลากหลาย