ไดเบนซิล มาลูเนต ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียด มันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบต่างๆ รวมถึงส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และเคมีภัณฑ์พิเศษ ความสามารถในการเกิดปฏิกิริยา เช่น การอัลคิลเลชัน ไฮโดรไลซิส และเดคาร์บอกซิเลชัน ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสีย้อม น้ำหอม และพอลิเมอร์ โดยกลุ่มเอสเตอร์ของมันมีบทบาทสำคัญในการปรับเปลี่ยนคุณสมบัติ เช่น ความสามารถในการละลายและความเสถียร ในงานวิจัย มักถูกใช้เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่