สารประกอบนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการไบโอคอนจูเกชันและการติดฉลากโปรตีน เนื่องจากมีกลุ่มไมลอิไมด์ ซึ่งทำปฏิกิริยาเลือกสรรกับกลุ่มไทออล (-SH) ในกรดอะมิโนซิสเตอีน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาแอนติบอดี-ยาคอนจูเกต (ADCs) โดยทำหน้าที่เป็นตัวเชื่อมโยงเพื่อติดยาที่มีพิษต่อเซลล์กับแอนติบอดี ทำให้สามารถบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมายได้ นอกจากนี้ ยังใช้ในการปรับเปลี่ยนเปปไทด์ โปรตีน และชีวโมเลกุลอื่นๆ สำหรับวัตถุประสงค์ทางวิจัยและการวินิจฉัย โครงสร้างหลักไซโคลเฮกเซนให้ความเสถียร ทำให้เหมาะสมสำหรับการใช้งานที่ต้องการโครงสร้างเคมีที่แข็งแกร่ง