ใช้ในงานทางการแพทย์ เช่น การถ่ายภาพด้วยคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้า (MRI) เพื่อเพิ่มความคมชัดของภาพ โดยอนุภาคนาโนจะทำหน้าที่เป็นตัวเพิ่มความต่างเชิงภาพ (contrast agent) นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการบำบัดด้วยความร้อนแม่เหล็ก (magnetic hyperthermia) สำหรับรักษามะเร็ง โดยเมื่ออนุภาคนาโนถูกกระตุ้นด้วยสนามแม่เหล็กสลับ จะเกิดความร้อนทำลายเซลล์มะเร็งได้ ในด้านสิ่งแวดล้อม ใช้ในการกำจัดมลพิษ เช่น โลหะหนักหรือสารอินทรีย์ในน้ำ เนื่องจากอนุภาคนาโนมีพื้นที่ผิวมากและสามารถแยกออกได้ง่ายด้วยสนามแม่เหล็ก ทำให้สามารถนำกลับมาใช้ใหม่ได้ ยังมีการนำไปใช้ในระบบส่งยาเฉพาะที่ โดยการเคลือบอนุภาคนาโนด้วยยาและควบคุมการปลดปล่อยยาไปยังตำแหน่งเป้าหมายในร่างกายด้วยสนามแม่เหล็กภายนอก ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการรักษาและลดผลข้างเคียง