สารดูดซับแม่เหล็กถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการบำบัดน้ำและน้ำเสีย เนื่องจากมีความสามารถในการกำจัดสารปนเปื้อน เช่น สารโลหะหนัก สีย้อม และสารอินทรีย์ต่างๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยการใช้สนามแม่เหล็กช่วยให้สามารถแยกสารดูดซับออกจากน้ำได้ง่ายและรวดเร็ว นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมอาหารและยาเพื่อการแยกและทำให้บริสุทธิ์ของสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีนและเอนไซม์ ซึ่งช่วยลดขั้นตอนและเวลาในการแยกสารได้อย่างมาก