3-Bromo-5-iodobenzonitrile ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยทางเภสัชวิทยาและวัสดุศาสตร์ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันไอโอดีนและโบรมีนที่สามารถทำปฏิกิริยาต่อเนื่องได้ดี ทำให้เป็นสารตั้งต้นที่สำคัญในการสร้างสารประกอบอินทรีย์อื่นๆ เช่น ยา สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ และสารประกอบที่ใช้ในอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในปฏิกิริยา cross-coupling เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ซึ่งเป็นเทคนิคสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมียุคใหม่