ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการศึกษากระบวนการสร้างไขมัน (lipid biosynthesis) โดยเฉพาะการสังเคราะห์ฟอสโฟลิปิด ซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักของเยื่อหุ้มเซลล์ มีบทบาทในการศึกษาเส้นทางเมแทบอลิซึมของไกลเซอรีนและไกลเซอรีน-3-ฟอสเฟต นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานในการวิเคราะห์ทางชีวโมเลกุลหรือในระบบชีวภาพที่ต้องการควบคุม pH เนื่องจากเกลือไซโคลเฮกซิลแอมโมเนียมช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายน้ำและเสถียรภาพของโมเลกุล